益生菌（Probiotics）是指一般認為食入後對宿主（如動物或人類）有正面效益的食入性微生物^[1][2][3]。

在醫學上，目前科學證據無法顯示益生菌的使用有助於改善免疫系統、改善腸道健康、緩解便秘及預防感冒等健康支持作用^[3][4][5]，美國聯邦貿易委員會也不允許這類宣稱療效的廣告^[6]。

益生菌一般來說是安全的，但在極少數個案中可能造成細菌-宿主交互作用及不良反應^[7][8][9]。

有研究人員認為若在抗生素治療後服用益生菌會阻礙腸道微生物組的恢復。^[10][11]